A ACS tem 11 centros clínicos próprios dispersos por 8 cidades do continente e regiões autónomas. Dispõe de 8 centros generalistas e 3 núcleos especializados em estomatologia e oftalmologia, nomeadamente, o Núcleo de Estomatologia de Lisboa (NEL), o Núcleo de Estomatologia do Porto (NEP) e o Núcleo de Oftalmologia de Lisboa (NOL).